数据集名称:台湾海峡浮游植物18S rRNA基因的V4区域测序原始数据
数据集专业类别:海洋生物
专业要素:真核浮游生物18S rRNA基因V4区序列、物种分类信息
数据集类型:原始数据
时间范围:2022-04-21 ~ 2022-04-26
数据集摘要:本数据是搭载国家自然科学基金委2021年春季台湾海峡共享航次,于2022年4月在台湾海峡西侧、福建沿岸春季赤潮频发海域采集的浮游植物样品的真核生物18S rRNA基因的V4区域测序的原始结果数据,由暨南大学于2025年5月23日提交,调查区域为:台湾海峡,共提交了0.386MB数据。
关键字:
DOI:10.12212/nsfcodc.LW-20260105170900
DOI引用格式:王朝晖.台湾海峡浮游植物18S rRNA基因的V4区域测序原始数据.暨南大学[创建机构],2025,国家自然科学基金青岛海洋科学资料共享服务中心[传播机构],2025-05-26.10.12212/nsfcodc.LW-20260105170900;https://doi.org/10.12212/nsfcodc.LW-20260105170900.
来源项目:共享航次计划2021年度台湾海峡科学考察实验研究(航次编号:NORC2022-04)
搭乘航次:NORC2022-04
搭乘航段:NORC2022-04台湾海峡航次春季航段
调查/观测平台类型:水面船
调查/观测平台名称:中国海监203号
仪器设备:
观测/取样方法:CTD采水
数据量(MB):0.386
文件数量:1
数据格式说明:原始 OTU 丰度表:CSV 格式,列字段包括OTU编号、各站位丰度值、分类注释(域/界/门/纲/目/科/属/种等级)
处理软件:Excel
资料处理人:张宇宁
处理方法描述:使用 DNeasy PowerWater DNA extraction Kit 试剂盒(Qiagen GmbH, Germany),采用改良的方法步骤,对保存待用的滤膜进行环境总 DNA 提取。使用 NanoDrop 2000 分光光度计(Thermo Scientific, USA)评估提取的总 DNA 浓度和质量。利用 T100 TM PCR 热循环仪(BIO-RAD, USA)对真核生物 18S rRNA 基因 V4 区进行扩增,其中正向引物为 3NDF: 5´-GGGCAATCTGGTGCCAG-3´(Cavalier-Smith et al., 2009),反向引物为 V4_euk_R: 5´-ACGGTATCTATCTCTTTTCG-3´(Bråte et al., 2010)。DNA测序使用Illumina PE300(Illumina, USA)高通量测序平台进行测序。PCR 扩增和 DNA 测序均委托上海美吉生物医药科技有限公司执行操作。
资料质量情况:31站数据经质控、OTU聚类(97%)及PR2注释。
其他说明:
数据产品:
致谢:本研究的数据及样品采集得到国家自然科学基金委员会共享航次计划项目(项目批准号:42149904)的资助。该航次(航次编号:NORC2022-04)由中国海监203号调查船实施,在此一并致谢。Data and samples were colected on board of R/V "Zhongguohaijian203" implementing the open research cruise NORC2022-04 supported by NSFC Shiptime Sharing Project(project number:42149904).
数据使用说明:为尊重知识产权、维护数据作者和数据服务提供者的权益,以扩展数据中心的服务、提升数据资源的应用潜力,请数据使用者在基于本数据所产生的研究成果(包括项目评估报告、验收报告、数据产品、论文以及论著等)中注明数据来源和数据生产者。请按照[DOI引用格式]的内容标注所引用的数据,并依据[致谢]的规范格式进行致谢。同时为更好地支持学术共享和成果统计,请通过海洋资料共享服务平台的“成果汇交”模块,将数据使用成果提交至“国家自然科学基金青岛海洋科学资料共享服务中心”。
时间标准:北京时间
大地坐标系:2000国家大地坐标系
投影类型:暂无
覆盖地理区域:台湾海峡西侧、福建沿岸
最小水深(米):
最大水深(米):
观测站次(个):31
测线长度(米):
测线数(个):
断面数(个):6
空间分辨率:
空间采样间隔:
时间分辨率:
数据提交日期:2025-05-26 00:00:00
数据获取方法:依据《国家自然科学基金共享航次计划调查资料管理与共享服务办法》申请获取
使用许可:署名 4.0 国际 (CC BY 4.0)
其他限制:
权利人:王朝晖
数据保护截止日期:
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